Фамилия Харатокова образована от прозвища Хараток, которое, вероятно, восходит к диалектному нарицательному «харатки» - так в псковских говорах называют «пожитки», то есть «прибыль, выручку, барыш, выгоду, пользу». Также это существительное имело значение «мелкое имущество, домашние вещи». Таким образом, Харатком могли называть либо зажиточного, богатого крестьянина, либо, наоборот, человека, не обладающего большим имуществом. Согласно другой версии, прозвище Хараток произошло от диалектного новгородского слова «харатка», имеющего значение «злая баба». В этом случае, прозвище Хараток могла получить коварная, сердитая, раздражительная женщина. Тогда, фамилия Харатокова относится к группе метронимических фамилий, образованных от женских прозвищ. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Хараток, со временем получил фамилию Харатокова.