Фамилия Харчнеко — украинская по происхождению, и её разумнее всего разбирать через призму украинской ономастики, а не привычной русской модели на -ов/-ев. В ней отчётливо видна суффиксальная модель -енк(о), которая в украинском языке образует фамилии со значением «маленький», «сын» или «потомок» (как в белорусском и польском суффикс -енко). То есть Харчнеко — это буквально «сын Харчка» или «потомок Харчка».

Основа фамилии — «Харч» или «Харчо». В украинском языке «харч» — это общее название пищи, съестных припасов, провизии (от тюркского «харч» — расходы на еду, через польское посредничество). Соответственно, прозвище Харч мог получить человек, имевший отношение к продовольствию: либо тот, кто торговал съестным, либо повар, либо просто любитель плотно поесть. В некоторых говорах «харч» могло означать и скудную, грубую пищу — так могли прозвать неприхотливого в еде человека.

Фамилия Харчнеко не является массовой и широко распространённой, что указывает на её локальное бытование, скорее всего, в центральных или восточных областях Украины. Встречаются варианты написания через «о» — Харчонко, но форма Харчнеко с «е» в суффиксе (не путать с Харченко, где корень «Харьк» от имени Харитон) — это именно производное от «харч», а не от имени.

Интересно, что в русском языке есть однокоренные фамилии Харчев, Харчов, Харчевин, которые образованы по иной модели (с суффиксом принадлежности -ев). Украинский же вариант Харчнеко — более прозрачный по смыслу: он не столько «принадлежащий Харчу», сколько «маленький Харч» или «сын того, кого звали Харч». Таким образом, предок носителя этой фамилии почти наверняка был человеком, чьё прозвище связывали с едой, столом или торговлей съестными припасами.