Фамилия Харзеев — редкий случай, где этимология не лежит на поверхности. Обычно фамилии на -ев образованы от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на -й, но здесь корень явно не славянский, и это заставляет искать объяснение в тюркских языках или в диалектной лексике.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским личным именем Харзы (или Харза). В тюркских языках «харзы» может означать «смелый», «отважный», «дерзкий», а иногда — «хищный зверь» (например, куница или хорёк). Прозвище Харза могли дать человеку с соответствующим характером или внешностью. Суффикс -ев указывает на «сына Харзы» или «принадлежащего Харзе», что типично для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён тюркского происхождения в XVI–XVII веках.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с русским диалектным словом «харзать» (пачкать, грязнить) или «харзя» (неряха, неопрятный человек). В таком случае Харзеев — потомок человека, которого дразнили за нечистоплотность. Однако эта гипотеза слабее, так как слово «харзать» узкорегиональное и фиксируется в основном в северных и сибирских говорах, а фамилия Харзеев встречается шире, в том числе в Поволжье и Приуралье, где сильны тюркские влияния.

Интересно, что фамилия не имеет распространённых вариантов вроде Харзов или Харзин, что говорит о её локальном характере и, возможно, о едином корне для большинства носителей. Встречается она редко, и по данным современных телефонных справочников, основные очаги — в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Это косвенно подтверждает тюркскую версию, так как именно в этих регионах активно шло смешение русского и тюркского населения.

Социальный контекст: скорее всего, предки носителей фамилии были служилыми людьми или казаками, которые перенимали прозвища у местных народов. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что типично для фамилий, возникших из прозвищ в крестьянской или посадской среде.