Фамилия Херунцев — один из тех случаев, когда звучание обманчиво, а корень ведёт совсем не туда, куда можно подумать. Никакой связи с бранной лексикой тут нет: перед нами вполне обычная отчество-патронимическая фамилия, образованная от прозвища или имени Херунец.

Основа Херун- восходит к диалектному слову «херун» или «херуня». В южнорусских и украинских говорах так называли хилого, слабосильного человека, замухрышку. Слово это, в свою очередь, связано с «херя» — так в некоторых областях (например, в воронежских и курских говорах) называли невзрачного, болезненного человека. Уменьшительно-пренебрежительный суффикс -ец в прозвище Херунец усиливал эту характеристику. Таким образом, человек с прозвищем Херунец — это, скорее всего, субтильный, тщедушный парень или мужик.

Фамилия образовалась по стандартной модели: прозвище на -ец (Херунец) + патронимический суффикс -ев. «Херунцев» буквально означает «сын Херунца». Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или ц (Херунец → Херунцев). Фамилия редкая, географически привязана к югу России и, возможно, к украинскому пограничью — именно там бытовали соответствующие диалектные слова.

Встречаются варианты написания с одной «н» — Херуцев, но это уже иная словообразовательная модель. Если ваша фамилия именно Херунцев, то перед нами классический случай, когда неблагозвучное прозвище закрепилось в качестве родового имени, и со временем его исходный смысл стёрся, оставив лишь фамильный звук.