Фамилия Херушкин — редкий пример, где основа ясна, а суффикс заставляет задуматься. В отличие от стандартных -ов и -ин, здесь работает модель с суффиксом -к-ин. Такое окончание в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на уменьшительную или уничижительную форму имени или прозвища, от которой образована фамилия: Херушка — сын Херушки.

Корень «хер-» в данном случае не имеет отношения к обсценной лексике. В старом русском языке (до реформы орфографии) слово «херъ» было названием буквы «Х» в кириллице. Отсюда пошли прозвища Хер, Херко, Херушка — их давали человеку, который по какой-то причине ассоциировался с этой буквой. Чаще всего так называли того, кто был похож на крест (начертание буквы «хер») — например, человека с перекошенной фигурой или того, кто постоянно крестился. В некоторых говорах «хером» называли дьячка или писаря, поскольку они постоянно имели дело с азбукой.

Второй, менее очевидный вариант — связь с диалектным глаголом «херить» (перечёркивать, уничтожать). Прозвище Херушка мог получить человек, который занимался вычёркиванием записей, исправлением документов или просто имел привычку перечёркивать написанное. Но эта версия слабее: от «херить» охотнее образовали бы фамилию Херин или Херов, а не через уменьшительный суффиск.

Фамилия Херушкин почти не встречается в современных справочниках и не имеет широкой географии. Скорее всего, она возникла в среде крестьян или низшего духовенства Центральной России или Поволжья, где были живы диалектные прозвища на «хер-». Благодаря суффиксу -к-ин фамилия звучит как «чей-то сынок»: Херушкин — буквально «сын Херушки». Это типичная модель для русских фамилий XVI–XVII веков, когда отчество от прозвища закреплялось за потомками.