Фамилия Химунина — женская форма, мужской вариант — Химунин. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Химуня. Чтобы понять, откуда оно взялось, стоит присмотреться к суффиксу -ун(я). В русском языке этот суффикс часто давал именам и прозвищам оттенок ласкательности или, наоборот, характеризовал человека по действию. Химуня — это уменьшительное от Хима, а Хима, в свою очередь, сокращение от крестильного имени Евфимий (мужская форма) или Евфимия (женская). Имя Евфимий греческого происхождения и означает «благочестивый», «священный».

Но есть и другая, более бытовая версия. Суффикс -ун в русских говорах мог указывать на человека, склонного к какому-то действию: ворчун, молчун, говорун. Соответственно, Химуня — это тот, кто «химит». В северных и сибирских диалектах глагол «химить» означал «хитрить, лукавить, плутовать», а также «воровать по мелочи». В таком случае родоначальник Химуниных получил прозвище за изворотливость или нечистую на руку натуру. Впрочем, в тех же говорах «химить» могло значить и «колдовать, знахарствовать», так что прозвище могло относиться к деревенскому лекарю или ведуну.

С точки зрения географии, фамилия Химунин (и, соответственно, Химунина) встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях — как раз там, где диалектное слово «химить» было в ходу. Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Химунина — это дочь или жена Химуни.

Таким образом, перед нами фамилия, которая почти наверняка пошла не от церковного имени, а от живого прозвища. И если первая версия (от Евфимия) делает предка «благочестивым», то вторая — человеком себе на уме, возможно, не без тёмной смекалки. Какая из них верна для конкретной семьи, без генеалогического исследования не узнать, но обе по-своему интересны.