Фамилия Химутина — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной, хотя по происхождению это типичная «матческа» (от имени или прозвища отца). Основа фамилии — Химута, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Химутин, то есть сын или потомок Химуты. Женское окончание -а сохранилось, вероятно, из-за того, что в документах фамилию записали сразу в форме жены или вдовы (как часто бывало в крестьянской среде), либо носительница — женщина, а мужской вариант Химутин существует параллельно.

Само прозвище Химута — производное от имени Хима, которое в свою очередь является краткой формой от канонического имени Евфимий (в просторечии Ефим) или от женского Евфимия (Ефимья). В русской народной традиции имена дробились на множество обиходных вариантов: Ефим → Ефимка → Фима → Хима. Прибавление суффикса -ута (как в Ванюта, Петрута) давало ласкательно-фамильярный оттенок. Таким образом, Химута — это «маленький Ефим» или «Ефимка», а фамилия буквально значит «внук (или дочь) Ефима».

Географически фамилия Химутина тяготеет к северным и центральным областям России, особенно к бывшим Вологодской и Архангельской губерниям, где были распространены формы с суффиксом -ута. Встречается она редко, в основном в Вологодской области и в некоторых районах Кировской области. Это указывает на то, что предки были, скорее всего, государственными или монастырскими крестьянами Русского Севера, где фамилии закрепились позже, чем в центральных губерниях, и часто образовывались от уличных прозвищ.

С точки зрения словообразовательной модели, Химутина стоит в ряду с фамилиями Ванютин, Петрутин, Мишутин — все они образованы от кратких форм крестильных имён с помощью того же суффикса -ут(а). Но если Ванюта и Петрута встречаются часто, то Химута — вариант более редкий, что делает фамилию локально уникальной.