Фамилия Хисикова — женская форма фамилии Хисиков, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа фамилии — «Хисик», что сразу указывает на её происхождение от прозвища или имени. Суффикс «-ов» в фамилии Хисиков типичен для русских фамилий, образованных от слов с мягким или шипящим окончанием: в данном случае «Хисик» даёт «Хисиков» (по аналогии с «Зверев» от «Зверь», но здесь основа оканчивается на «-ик»). Однако суффикс «-ик» в русской ономастике часто указывает на уменьшительную или уничижительную форму имени или прозвища.

Самая вероятная гипотеза — связь с тюркским корнем «хыс» или «кыс», что означает «девушка», «девица». В тюркских языках, особенно в татарском, башкирском, казахском, слово «кыз» (девушка) могло трансформироваться в «хыс» под влиянием диалектов. Тогда «Хисик» — это уменьшительное прозвище, данное человеку с женственными чертами, нежным голосом или просто младшему в семье (сравните с фамилией Кызылов, Кысыков). Такие прозвища не несли оскорбительного смысла, а скорее описывали внешность или характер.

Менее вероятная версия — от имени «Хисам» (арабское «меч»), которое могло сократиться до «Хис» и получить русский суффикс «-ик». В этом случае фамилия была бы родственна татарским Хисамовым, Хисматуллиным. Но форма «Хисик» встречается редко, и в русских говорах нет слова «хисик» или «хис» с самостоятельным значением, что делает тюркскую гипотезу основной.

Географически фамилия Хисикова редкая, с концентрацией в Поволжье и на Урале — регионах, где столетиями жили татары, башкиры и русские, перенимавшие друг у друга прозвища. Сословно предки носителей фамилии могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, но из-за редкости фамилии точных данных о дворянском статусе нет. Фамилия не входит в списки известных родов, что говорит о её простонародном происхождении.

Особенность написания — буква «Х» в начале, нехарактерная для исконно русских фамилий (чаще встречается у заимствованных или тюркских основ). В дореволюционных записях могла писаться через «К» — «Кисикова», но современная форма закрепилась с «Х», что отражает реальное произношение в диалектах. Сравнение с однокоренными фамилиями — Хисамов, Хисматуллин — подтверждает тюркский след, но Хисикова стоит особняком из-за уменьшительного суффикса «-ик».