Фамилия Холли — редкий пример, когда русская по форме фамилия имеет почти наверняка нерусское происхождение. В ней нет типичных славянских суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский), а окончание -и в русском языке чаще встречается у фамилий в форме родительного падежа множественного числа (типа Черных, Долгих) или у заимствованных. Но «Холли» — не из этого ряда. Скорее всего, перед нами транслитерация английской фамилии Holli или Holly.

В англоязычном мире Holly — это либо топонимическая фамилия от названия места (например, населённых пунктов Holly в Мичигане или Колорадо), либо прозвище от слова holly — «падуб», вечнозелёное растение с красными ягодами, символ Рождества. В редких случаях это могла быть сокращённая форма от имени Hollister. Таким образом, носитель фамилии Холли в России — потомок иностранца, вероятно, британца или американца, который обосновался в стране в XVIII–XIX веках.

В русском контексте фамилия могла возникнуть и иначе: как искажённое написание при переписи. Например, украинская или белорусская фамилия Холя (от прозвища Холя — «изнеженный, холёный человек») при записи через «и» дала бы Холли. Но это маловероятно: в дореволюционных документах такое написание почти не встречается. Единичные случаи фиксации фамилии Холли в России относятся к началу XX века и связаны с семьями обрусевших немцев или шведов.

Интересная деталь: окончание -и в русской передаче фамилии не склоняется по падежам (Холли, Холли, Холли), что выдаёт её иноязычный корень. Среди однокоренных русских фамилий аналогов нет — это изолированный случай, который стоит особняком в ономастическом ландшафте. Если вы носите эту фамилию, ваша родовая история, скорее всего, уходит корнями в Западную Европу, а не в крестьянскую среду Российской империи.