Фамилия Холобуда — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти прозрачно, но его бытовой смысл ставит в тупик. Первая часть — «холо-», скорее всего, от «холостой» (неженатый). Вторая — «буда»: в южных и западных говорах так называли строение, будку, временное жильё, а также постройку для промышленных нужд (винокурня, селитряный завод). Складывается картина: «холостая буда» — одинокое строение, и такое прозвище мог получить человек, живший в отдалённом доме отдельно от села. Но есть и вторая, не менее логичная версия: «холобуда» — это человек, который «холостит», то есть живёт бобылём, в собственной «буде», без семьи. В любом случае, перед нами прозвище по образу жизни или месту жительства.

Модель образования фамилии проста: суффикс -а, характерный для украинских и южнорусских фамилий, которые закрепили прозвище в чистом виде, без патронимических суффиксов (-ов, -енко). Носители фамилии Холобуда — это потомки человека, которого в своё время назвали «Холобуда». Фамилия недвусмысленно указывает на социальный контекст: её давали не боярам и не купцам, а простому люду — крестьянам или казакам. Географически она тяготеет к Украине, особенно к левобережным и полтавским землям, а также к югу России, куда переселялись украинцы.

У фамилии есть редкая особенность: ударение. В русском языке его часто ставят на последний слог — Холобудá, что созвучно с «голотура» и создаёт ощущение некой несуразности. В украинском же варианте ударение может падать на второй слог — Холобýда, что ближе к исходному смыслу «холостая буда». Спор о корне «холо-» решается просто: в украинском языке «холостий» — холостой, а не «голый», поэтому версия с «голой будой» — народная этимология, хотя и забавная. Сравнение с однокоренными фамилиями (Холостяк, Холостов, Будин, Будник) показывает, что Холобуда стоит особняком — это не просто «сын холостого», а цельная характеристика человека и его жилья.