Фамилия Хомышыш — редчайший случай в русской ономастике. Если вы её носитель, скорее всего, в вашей семье передаётся история, объясняющая такое необычное звучание, потому что стандартные модели образования русских фамилий здесь не работают. В фамилии нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а окончание -ыш указывает на украинское или белорусское происхождение.

Скорее всего, основа «Хомыш» — это производная форма от имени или прозвища. Самый очевидный вариант: «Хома» — украинский и белорусский вариант имени Фома (от арамейского «близнец»). Суффикс -ыш в восточнославянских говорах часто придаёт слову значение «детёныш» или «нечто маленькое» (ср. галыш, малыш). Тогда Хомышыш могло означать «внук или потомок Хомы», причём суффикс повторился дважды (Хом-ыш-ыш), что для фамилий нетипично и говорит о возможной описке или народной переделке.

Вторая версия, более прозаичная: перед нами искажённое написание. При переписи или в документе могли записать фамилию на слух, и изначально она выглядела как Хомышев (от прозвища Хомыш) или Хомышин. Двойной суффикс мог появиться из-за того, что писарь услышал окончание как -ыш, а потом машинально дописал ещё одно -ыш, чтобы «закрепить» звучание. Такие ошибки встречаются в глухих деревнях, где грамотность была редкостью.

Географически фамилия с такой структурой тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — современной Украине, Беларуси, юго-западу России (Брянская, Смоленская области). Там имя Хома было распространено, а суффикс -ыш активно использовался в прозвищах. Предок мог быть просто человеком по имени Хома, а его потомков в быту называли «Хомышами», а затем «Хомышами» — и так закрепилось в документах.

Если ваша семья хранит устное предание о происхождении фамилии, оно почти наверняка правдивее любых гипотез, потому что таких фамилий в официальных справочниках единицы. В любом случае, Хомышыш — это не ошибка природы, а живой след местного говора и канцелярской случайности, превратившийся в уникальный родовой знак.