Фамилия Хоникбоев — редкий случай в русском ономастиконе. На слух она звучит нерусски, и это верно: её основа восточная, а суффикс — русский по происхождению, что выдает позднее оформление фамилии по русской модели.

Разбираем по составу. Корень — «Хоникбо». Скорее всего, это искажённое или транслитерированное имя или прозвище. Вероятнее всего, перед нами тюркское или иранское имя Хоникбек (Хоник-бек). Первая часть «Хоник» может восходить к персидскому «хан» (владыка, правитель) с уменьшительным или ласкательным аффиксом, либо к тюркскому «конык» (гость, пришелец). Вторая часть «бек» (или «бой») — тюркский титул, означающий князя, господина. Таким образом, имя Хоникбек могло значить «маленький хан» или «гость-бек». Суффикс «-ев» — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Хоникбоев, то есть сын Хоникбека. Ударение, судя по произношению, падает на последний слог: Хоникбо́ев.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешивались тюркские и иранские народы с русским населением: Средняя Азия (Узбекистан, Таджикистан), Кавказ, Поволжье. В России она встречается крайне редко, в основном у потомков переселенцев или в смешанных семьях.

Социальный контекст. Фамилия образована от имени с титулом «бек», что говорит о возможном знатном или уважаемом происхождении предка. Но в XIX–XX веках такие фамилии часто получали не только потомки аристократии, но и зажиточные крестьяне, купцы или духовные лица, чьё имя было записано с титулом в метрических книгах. Русский суффикс «-ев» указывает, что фамилия была оформлена уже после вхождения региона в состав Российской империи, когда местные имена адаптировали под русскую бюрократическую систему.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет. Можно вспомнить Хоников, Ханбеков, Хангишиев, но все они — параллельные образования от схожих основ. Фамилия Хоникбоев стоит особняком: она сохранила исходное имя почти без изменений, лишь добавив типовое окончание. Это делает её ценным маркером для генеалогического поиска — предка, скорее всего, звали именно Хоникбек, и запись о нём стоит искать в метрических книгах мусульманских приходов конца XIX — начала XX века.