Фамилия Хракин образована от прозвища Храка — так в русских говорах называли человека с хриплым, сиплым голосом или того, кто сильно кашлял, «хракал». Глагол «хракать» означал «кашлять, хрипеть, откашливать мокроту». В основе лежит звукоподражательный корень, родственный общеславянскому *chrъkati. Фамилия относится к типичной модели на -ин, указывающей на принадлежность: «чей?» — Хракин, то есть сын или потомок Храки.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и южнорусских областях. В переписных книгах XVII века фиксируются крестьяне с прозвищем Храка — например, в воронежских и рязанских землях. В XIX веке Хракины нередко записаны среди однодворцев и государственных крестьян. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на древнюю основу на -а, что типично для прозвищ, описывающих физическую особенность или поведение.

Редкость фамилии объясняется тем, что прозвище Храка могло закрепиться за человеком с хронической болезнью горла или просто за тем, кто говорил хрипло. В народе такие прозвища давали без злого умысла — по внешнему или звуковому признаку. Со временем оно перешло в фамилию, потеряв первоначальную описательность.

Однокоренные фамилии — Храпов, Храпков, Храповицкий — образованы от того же глагола, но с другим суффиксальным оформлением. Хракин стоит несколько особняком: если Храпов могло быть связано и с храпом во сне, то Хракин почти наверняка восходит именно к «храканью» — кашлю, хрипоте. Это делает фамилию ярким примером того, как бытовая характеристика человека становилась его родовым именем.