Фамилия Храпоченко — типичный пример восточнославянской фамилии, образованной по патронимической модели. Её основа — прозвище или некалендарное имя Храп, Храпко. Ключевой элемент здесь суффикс -енко, характерный для украинской и отчасти белорусской традиции. В XVII–XVIII веках фамилии на -енко активно формировались в среде казачества и крестьянства Левобережной Украины, Слобожанщины и юга России. Суффикс -енко буквально означает «маленький» или «сын», то есть Храпоченко — это «сын Храпка» (уменьшительная форма от Храп).

Что могло лежать в основе прозвища Храп? Самое прямое и очевидное — человек, который сильно храпит во сне. Такие прозвища по физиологической особенности давали часто и без злого умысла, просто как примету. Однако в старых русских говорах у слова «храп» были и другие значения. В некоторых диалектах «храпом» называли высокомерного, заносчивого человека, а также лошадиную морду или часть конской сбруи. Не исключено, что прозвище мог получить и коновод, либо человек с крупными чертами лица.

Стоит отметить, что фамилия Храпоченко встречается реже, чем однокоренные Храпов или Храпко. Это объясняется географией: -енко — южный маркер. Если Храповы рассеяны по всей России, то Храпоченко концентрируется в исторических пределах Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Восточной Сибири. В официальных документах фамилия фиксируется с XVIII века, но, как и многие крестьянские фамилии, могла бытовать устно задолго до того.