Фамилия Хрястунов в своей основе имеет не имя, а прозвище или мирское имя. Слово «хряст» в русских говорах означало хруст, треск, звук ломающегося дерева или костей. В переносном смысле так могли прозвать человека грузного, тяжелого на подъем, который сам производил такой звук при ходьбе, либо того, кто отличался резкостью и напором, «ломал» любые преграды. Не исключена и связь с диалектным глаголом «хрястать» — бить, колотить, что могло закрепиться за драчуном.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе «Хряст» добавили суффикс -ун-, который часто выделял деятеля по характерному действию или свойству (ср. Болтун, Говорун, Крикун). Получилось «Хрястун» — тот, кто хрястает. Затем к этой форме прибавили патронимический суффикс -ов, и фамилия стала означать «сын Хрястуна» или «принадлежащий роду Хрястуновых». Таким образом, первый носитель фамилии был потомком человека с прозвищем Хрястун.

Фамилия редкая и нечастотная. В дореволюционных переписях и справочниках она почти не встречается, что указывает на локальное бытование, скорее всего, в центральных или северных губерниях России, где диалекты сохраняли слово «хряст». Встречаются варианты написания с одной буквой «с» — Хрястунов, что не меняет этимологии.

Стоит отделить фамилию от созвучных «Хрящев» или «Хряпов» — у них совсем другая основа: «хрящ» (анатомический) или «хряп» (огородный отход). Хрястунов же — фамилия звукоподражательная, от бытового, почти осязаемого прозвища. Предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими уличное имя за манеру поведения или физические данные.