Фамилия Хрыськова — женская форма фамилии Хрыськов, и её разбор стоит начать с мужского варианта, так как именно он хранит ключ к происхождению. Основа фамилии — «Хрыськ» — это, скорее всего, прозвище или производная форма личного имени. Суффикс «-ов» указывает на типичную восточнославянскую модель образования: «чей?» — потомок или человек из рода Хрыська.

Самая вероятная версия происхождения корня связана с украинским или южнорусским словом «хрысь» — так в некоторых говорах называли хряка, то есть кастрированного самца свиньи. Прозвище Хрысь могли дать человеку по сходству с животным (например, за упрямство, грузность или особый тембр голоса) либо по роду занятий — свинопасу, торговцу свиньями или тому, кто занимался холощением скота. В пользу этой версии говорит и географическая привязка: фамилия Хрыськов (и её вариации) встречается прежде всего в Белгородской, Курской, Воронежской областях и на востоке Украины — как раз в зоне распространения южнорусских говоров, где слово «хрысь» было в ходу.

Менее вероятна, но возможна связь с крестильным именем Хрисанф (от греческого «златоцветный»). В народном произношении оно могло сократиться до Хрысь, а затем и до Хрысько. Однако эта версия слабее: от имени Хрисанф обычно образовывались фамилии вроде Хрисанфов, а форма Хрысь — слишком сильное фонетическое искажение для русского языка XVIII–XIX веков, когда фамилии уже фиксировались письменно.

Ещё один вариант — что прозвище Хрысь дали человеку с хриплым, сиплым голосом. В некоторых диалектах «хрысь» или «хрысеть» означало хрипеть, издавать сиплый звук. Такое прозвище могло закрепиться за тем, кто говорил «с хрипотцой» или постоянно простужался.

Фамилия Хрыськова — редкая, не входит в список массовых русских фамилий. Встречается в основном в сельской местности Черноземья, что косвенно подтверждает её происхождение от прозвища по занятию или внешнему признаку, а не от церковного имени. Носители фамилии, вероятно, были крестьянами или мещанами, и в основе их родового прозвища лежало что-то очень конкретное и бытовое — свинья, хрипота или упрямство.