Фамилия Худайназаров — яркий пример тюркско-персидского именослова, адаптированного русской патронимической моделью. Её основа — составное мужское имя Худайназар, которое распространено у многих народов Средней Азии: узбеков, таджиков, туркмен, каракалпаков. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия была русифицирована в период вхождения региона в состав Российской империи или в советское время, когда нерусским народам массово оформляли документы по русскому образцу: «чей?» — Худайназаров, то есть сын (или потомок) Худайназара.

Сам антропоним Худайназар состоит из двух корней. Первый — «Худай» (варианты: Ходай, Кудай) — в тюркских и иранских языках означает «Бог», «Всевышний» (ср. персидское «Хода»). Второй — «назар» — арабского происхождения, переводится как «взгляд», «око», а в переносном смысле — «обет», «дар». Таким образом, имя Худайназар можно истолковать как «Божий дар» или «тот, кто дан Богом». Это типичное имя-оберег или имя-пожелание, которое давали долгожданному ребёнку, чтобы подчеркнуть его ценность и небесное покровительство.

Интересно, что фамилия сохранила ударение на последний слог — Худайназа́ров, что характерно для многих восточных фамилий, попавших в русский язык. В отличие от исконно русских фамилий на -ов, где ударение часто подвижно, здесь оно закреплено за основой, и это сразу выдаёт её нерусское происхождение.

Встречается фамилия в основном в Узбекистане, Таджикистане, а также среди диаспор в России, Казахстане и на Украине. В дореволюционных источниках носители могли записываться и как Худай-Назаров, с дефисом, что подчёркивало составной характер имени. Однокоренные фамилии — Худайбердиев («Бог дал»), Худайкулов («раб Божий») — образуют целое гнездо, где первый элемент «Худай» указывает на религиозный контекст именования, характерный для исламизированных тюркских культур.