Фамилия Худинша — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но при этом ставит в тупик любого, кто пытается разобрать её «по косточкам». С первого взгляда видна финаль «-ша», которая в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на нерусское происхождение или на особую модель образования.

Самое вероятное объяснение — фамилия Худинша образована от прозвища или имени Худин с помощью суффикса -ша. Этот суффикс в восточнославянской антропонимии выполнял роль уменьшительно-ласкательного или даже уничижительного. Он мог присоединяться к полным именам (Антон — Антоша, Матвей — Матюша) или к прозвищам. В данном случае основа «Худ-» наводит на мысль о прилагательном «худой» — тощий, бедный, плохой. Прозвище Худин могли дать человеку за худобу, невысокий рост или за неудачливость. В говорах «худой» означало также «плохой, дурной», так что прозвище могло носить и оценочный, ироничный характер. Фамилии с корнем «Худ-» (Худяков, Худов, Худин) широко распространены в России, и Худинша — их более редкая, «уменьшительная» разновидность.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная для южных и западных регионов, — связь с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «худа» или «худай» означает «бог», а суффикс -ша мог быть заимствован из персидского или арабского (например, «падишах»). Однако в таком случае фамилия выглядела бы скорее как Худайша или Худаша, а не Худинша. Фонетика «Худинша» ближе к славянской модели, где корень «худ-» и суффикс -ин (указывающий на принадлежность) слились с -ша.

Географически фамилия Худинша, судя по редкой встречаемости, тяготеет к югу России или к Поволжью — регионам, где пересекались славянские, тюркские и финно-угорские влияния. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении или о бытовании в среде крестьянства, не оставившего обильных письменных следов. Дворянской эта фамилия точно не была: суффикс -ша в русской аристократической среде не использовался.

Таким образом, предки носителя фамилии Худинша с высокой долей вероятности — крестьяне или посадские люди, получившие прозвище Худин («худой, тощий»), а их потомки закрепили за собой ласкательную форму этого прозвища. Фамилия сохранила живой оттенок народной речи, где даже нелестное прозвище могло стать фамильным именем на века.