Фамилия Хужаматова — женская форма фамилии Хужаматов, которая образована от мужского личного имени Хужамат. Это имя, в свою очередь, является сложным: оно восходит к двум арабским корням. Первая часть «Хужа» — это вариант имени Ходжа (от персидского «хваджа» — господин, хозяин, наставник). Вторая часть «мат» — это сокращение от арабского имени Мухаммад (прославляемый, достохвальный). Таким образом, имя Хужамат можно перевести как «господин Мухаммад» или «почтенный, как Мухаммад».

Фамилии такого типа характерны для народов, исповедующих ислам, и в первую очередь для татар, башкир, а также народов Средней Азии (узбеков, таджиков). Суффикс -ов/-ев и окончание -а в женской форме — это типичная русская модель адаптации нерусских фамилий. В русском языке, когда нужно было записать фамилию мусульманина в метрические книги или паспорт, к основе имени добавляли именно этот суффикс, указывающий на принадлежность роду.

Несмотря на кажущуюся прозрачность, у фамилии есть одна особенность, выделяющая её среди десятков похожих. В татарской среде имя Хужамат могло быть не только прямым именем, но и прозвищем, которое давали уважаемому человеку, имевшему духовный сан или занимавшемуся торговлей. В отличие от фамилий на -уллин (например, Хужамуллин), которые прямо указывают на отчество («сын Хужи»), фамилия Хужаматов чаще фиксирует именно имя, данное при рождении, а не прозвище отца.

Предки носительницы фамилии Хужаматова, скорее всего, были выходцами из среды служилых татар или торговых людей Поволжья и Приуралья. В сословном отношении они могли относиться к государственным крестьянам или купечеству, но не к дворянству, поскольку фамилия не имеет аристократического суффикса -ский. Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном происхождении — вероятно, от одной родовой ветви в каком-либо конкретном селе.