Фамилия Хвисенко — характерный пример украинской модели фамилии на -енко, которая означает «маленький», «сын» или «потомок» того, кто назван в корне. В данном случае основа — Хвис. Суффикс -енко в украинской ономастике (как отмечал, в частности, Б. Унбегаун) был самым массовым способом образования фамилий в XVII–XVIII веках, особенно на Левобережной и Слободской Украине. Носитель такой фамилии — потомок человека по прозвищу или имени Хвис.

Что скрывается за корнем Хвис? Тут возможны два основных пути. Первый: это фонетический вариант имени Феофил, Филипп или Фома — в украинских говорах начальное «ф» часто заменялось на «хв» (сравните Хведор из Фёдор, Хвилип из Филипп). Соответственно, Хвис могло быть сокращённой формой от Хвилип (Филипп) или от Хвилон (Феофилакт). Такой путь — от канонического имени через народную форму — типичен для крестьянских фамилий.

Второй вариант: прозвище от глагола «хвистати» — в украинском языке это значит «хлестать», «бить», «стегать». Хвис — тот, кто хлещет, или, в переносном смысле, человек с резким, «хлёстким» характером. Эта версия менее вероятна, но не исключена: прозвища по действию давали нередко. Сравните с фамилией Хвистун (от «хвист» — хвост, или от того же корня), но тут корень короче.

Географически фамилия Хвисенко почти наверняка происходит из центральных или восточных областей Украины (Полтавщина, Черниговщина, Слобожанщина), где суффикс -енко был доминирующим. В России эта фамилия редкая и, скорее всего, принесена переселенцами или мигрантами XIX–XX веков. Социальный контекст: фамилии на -енко до середины XVIII века не были закреплены за дворянством — их носили казаки, мещане и крестьяне. Так что предки Хвисенко с высокой вероятностью были свободными сельскими жителями или казаками, а не крепостными.

Таким образом, фамилия Хвисенко означает «потомок Хвиса», а сам Хвис — это, скорее всего, украинская разговорная форма имени Филипп или Фома.