Фамилия Кидон — редкая и неочевидная для русского уха. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, которые сразу указывают на отчество или принадлежность. Сама форма — чистая основа, без наращений, что типично для фамилий, возникших из прозвищ или старых нецерковных имён. Такие «голые» фамилии могли закрепиться в крестьянской среде на севере и в некоторых регионах Украины, где патронимический суффикс иногда опускали.

Корень «кид-» в русском языке связан с глаголом «кидать» и его производными. Прозвище Кидон могли дать человеку порывистому, резкому в движениях или, наоборот, тому, кто занимался метанием — например, бросал сети в рыболовецком деле. В говорах «кидон» могло означать и нечто вроде «кидала» — не в современном криминальном смысле, а как прозвище человека, который часто что-то бросает, не удерживает. Однако возможна и другая версия: фамилия может восходить к диалектному слову «кидон» в значении «сметливый, бойкий» — в некоторых областях так характеризовали расторопного парня.

Фамилия могла возникнуть и как форма от канонического имени Никита через усечение: Кида (уменьшительное от Никита) плюс суффикс -он, который в северных говорах нередко замещал более привычные окончания. В этом случае Кидон — это «сын Киды», то есть Никитич, но без отчества, а как личное прозвище, перешедшее в фамилию. Такой путь типичен для фамилий, которые фиксировались в переписях в виде «Ивашко Кидон» или «Сенька Кидоныч».

Географически фамилия встречается крайне редко, в основном на северо-западе России и в Поволжье, где были сильны старые прозвищные традиции. В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова прямого упоминания Кидон нет, что подтверждает её локальный и нетиражированный характер. Это не фамилия дворянского рода или купеческой династии — скорее, прозвище одного человека, которое закрепилось за его потомками в небольшой деревне или слободе.

Если отталкиваться от словообразовательной модели, то Кидон — это типичная «прозвищная» фамилия, где суффикс -он выполняет ту же роль, что и -ун (ср. Болтун, Говорун). То есть Кидон — «тот, кто кидает» или «тот, кто кидок». В любом случае, основа прозрачна для русского языка, а сама фамилия — редкий пример того, как простое действие стало именем рода.