Фамилия Килинкарова — одна из тех, чей корень уходит в тюркскую языковую среду. В её основе лежит прозвище Килинкар, которое образовано сложением двух смысловых блоков. Первая часть, «килин», восходит к древнетюркскому корню kil с суффиксом -in, что в целом передаёт значение «совершение» или «делание». Вторая часть — «кар» — связана с тюркским корнем kâr, означающим «доход», «прибыль» или «выгода». Сложив эти значения, прозвище Килинкар можно истолковать как «тот, кто делает прибыль», то есть человек, чья деятельность приносит доход.

Скорее всего, именование Килинкар носило профессиональный характер. Так в тюркской среде могли прозвать удачливого купца или ловкого торговца, который умел заключать выгодные сделки. Прозвище закрепилось за родом, и со временем потомки человека по прозвищу Килинкар стали носить фамилию Килинкаровы. Женская форма Килинкарова — естественное отражение русской грамматической традиции, где дочери и жёны получали фамилию по мужской линии.

Словообразовательная модель здесь необычна: суффикс -ов в фамилии Килинкаров присоединён к основе, которая сама по себе уже является сложным тюркским именованием. Это отличает её от более простых фамилий, образованных от одного корня (например, от имени или ремесла). Фамилия Килинкарова — редкий пример, где в русской фамильной форме сохранилась двухчастная тюркская лексема с чётко читаемой семантикой «делающий прибыль».

Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном происхождении: вероятно, род Килинкаровых был распространён в регионах с сильным тюркским влиянием — в Поволжье, на Урале или в южнорусских степях, где смешивались славянские и тюркские традиции имянаречения.