Фамилия Килофян — яркий пример фамилии, образованной по армянской модели с суффиксом -ян. Этот патронимический суффикс, восходящий к древнему -янц, означает «принадлежащий к роду» или «потомок такого-то». Иными словами, Килофян — это потомок человека по имени или прозвищу Килоф.

Основа фамилии, «Килоф», — нестандартная и редкая. Её происхождение вызывает споры, и есть две основные версии. Первая, более вероятная: это вариант армянского имени или прозвища Геворг (армянская форма Георгия), которое через диалектные формы могло преобразоваться в Килоф. В армянском языке существует имя Киворк (вариант Геворга), и «Килоф» могло быть его искажением или местным произношением. В таком случае фамилия означает «потомок Георгия» (в армянской традиции — Св. Георгия Победоносца).

Вторая версия связывает основу с тюркскими корнями, например, с турецким «kilif» (меч) или «kılıç» (сабля). Однако для армянской фамилии это менее типично, хотя контакты с тюркоязычными народами на Кавказе и в Малой Азии были долгими. Прозвище «Меч» могло закрепиться за воином или оружейником. Тем не менее, версия с именем Геворг выглядит более убедительной, так как армянские фамилии чаще образуются от личных имён, особенно от распространённых церковных.

Географически фамилия Килофян почти наверняка восходит к западным армянам — выходцам из Западной Армении (территория современной Турции) или из армянской диаспоры Ближнего Востока. Массовый исход армян в начале XX века разнёс такие фамилии по всему миру, поэтому сегодня Килофяны чаще встречаются в армянских общинах России, США, Франции и Ливана, чем на исторической родине.

Социальный статус предков определить сложно. Если основа — от имени, то носители были крестьянами или ремесленниками, как и большинство армян того региона. Если же в основе лежит прозвище от «меча», то предок мог быть военным. Но в любом случае, это фамилия не аристократическая, а родовая, указывающая на конкретного человека, от которого пошёл род.

Сама по себе фамилия Килофян — редкий ономастический случай, где диалектное произношение имени породило уникальную форму, не встречающуюся в массовых списках. Это не Килосян, не Килоян, а именно Килофян, что делает её лёгкой для идентификации в архивах.