Фамилия Киона — редкая и загадочная, её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она не имеет славянских корней, а её носители в России — потомки выходцев из других регионов или результат искусственного образования. Главная версия — греческое происхождение. В греческом языке существует женское имя Χιόνη (Хиони), которое означает «снежная», «белая как снег». В русской традиции это имя могло трансформироваться в фамилию через отчество: сын Хионы — Кионов, а затем, при усечении, — Киона. Форма без суффикса -ов/-ин встречается редко и указывает на то, что фамилия могла быть записана в исходном, неадаптированном виде или принадлежала к духовному сословию, где греческие имена и фамилии были распространены.

Вторая, менее вероятная версия — топонимическая. На карте мира есть несколько мест с похожим названием, например, гора Киона в Греции или река Киона в Восточной Сибири. В этом случае фамилия могла возникнуть у человека, который приехал оттуда или жил на берегу такой реки. Однако для русской ономастики такая модель (прямое перенесение названия без суффикса) нехарактерна и встречается в основном у нерусских народов или у старообрядцев, которые иногда брали фамилии от названий мест, где селились.

Особенность фамилии — её окончание на -а при мужском роде. Это типично для фамилий греческого, молдавского или украинского происхождения, где склоняемые формы на -а не редкость (например, Сковорода, Макаренко). В русском языке такие фамилии склоняются по падежам: Кионы, Кионе, Киону. Поскольку фамилия крайне малочисленна, её география размыта: единичные носители встречаются в Москве, Санкт-Петербурге и на юге России, где традиционно сильнее греческое влияние.

Если отбросить экзотические версии, то самый правдоподобный путь фамилии — из греческого имени Хиони, которое давали девочкам, родившимся зимой или с очень светлой кожей. Прозвище «Снежная» закрепилось за родоначальником, а затем перешло в фамилию, сохранив свою редкую форму без русифицирующих суффиксов.