Фамилия Кисец — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её происхождение стоит искать не в географическом названии или профессии, а в прозвище, причем прозвище это могло быть дано человеку по двум совершенно разным причинам.

Первая и наиболее вероятная версия отсылает к диалектному слову «кисец». В некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, так называли небольшой мешочек или кошелек, который носили на поясе. Слово образовано от «киса» — сумка, мошна. Прозвище Кисец мог получить либо бережливый, прижимистый хозяин, который не расставался с кошельком, либо, наоборот, человек, промышлявший кражей таких кошельков (карманник). Суффикс -ец в этом случае указывает на носителя признака: «тот, кто имеет отношение к кисе». Модель образования простая и прозрачная: основа «кис-» плюс уменьшительно-идентифицирующий суффикс.

Вторая версия, менее распространенная, но имеющая право на существование, связывает фамилию с птицей. В старых орнитологических названиях «кисец» могло быть местным вариантом имени для какой-либо мелкой птицы (возможно, искаженное «чиж» или «клест»). Тогда прозвище дали бы человеку за внешнее сходство — невысокий, юркий, с острыми чертами лица. Однако эта гипотеза слабее: она не подкреплена устойчивой диалектной фиксацией, в отличие от «кошелька».

В написании фамилии подкупает отсутствие типичных патронимических суффиксов (-ов, -ин). Кисец — это чистая основа прозвища, застывшая в именительном падеже. Такая форма характерна для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, а также для прозвищ, которые не успели обрасти фамильным суффиксом до момента фиксации в документах. Поэтому географически Кисец может встречаться как на юге России, так и в восточных регионах Украины, куда переселенцы принесли северорусскую лексику.

Однокоренные фамилии — Кисов, Кисин, Кисляков — имеют совсем другую семантику (от «кислый» или от имени Киса). Кисец стоит особняком: он не связан ни с кислым вкусом, ни с уменьшительным именем. Это редкий случай, когда прозвище, означающее конкретный предмет обихода, стало фамилией, минуя стадию отчества.