Фамилия Кишлаковы образована от прозвища или имени Кишлак, которое восходит к тюркскому слову «кышлак» — «зимовье, зимнее стойбище». В тюркских языках «кыш» означает «зима», а суффикс «-лак» указывает на место. Соответственно, Кишлаком могли называть человека, который родился или жил на зимнем пастбище, либо того, кто занимался перегоном скота на зимовку. В русской среде это тюркское слово закрепилось как прозвище, а затем, с добавлением типичного русского суффикса -ов, превратилось в фамилию.

Фамилия Кишлаков — один из многих примеров, когда русские фамилии ведут начало от тюркских корней. Такая же модель образования у фамилий Тургенев (от «турген» — «быстрый»), Аксаков (от «аксак» — «хромой»), Булгаков (от «булгак» — «беспокойный»). Все они — памятники восточной культуры, вплетённые в русскую ономастику.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Кишлаков — «сын Кишлака» или «из рода Кишлака». Это типичная модель для русских фамилий, сложившаяся в XV–XVII веках у служилых и крестьянских родов после присоединения поволжских и южных территорий, где тюркское население смешивалось с русским.

Географически фамилия Кишлаков встречается в нескольких регионах: есть следы в бывших Казанской и Симбирской губерниях, а также на Урале. Это совпадает с зонами длительного русско-тюркского контакта. Встречаются варианты написания — Кишлаков и Кишлакова (для женщин), но мужская форма остаётся неизменной.

Передаваясь из поколения в поколение, фамилия Кишлаков по сей день хранит память о происхождении предка — человека, чья жизнь была связана с зимним кочевьем или сезонным скотоводством. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Кишлаков можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.