Фамилия Кисткина — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В её основе лежит прозвище Кистик, которое могло появиться как минимум двумя разными путями, и какой из них вернее — вопрос открытый.

Первая версия отталкивается от диалектного глагола «кистать». В некоторых говорах это слово означало «бить, хлестать, стегать». Если прозвище Кистик дали человеку, который часто и охотно пускал в ход кулаки или плётку, то со временем оно закрепилось за его потомками. В этом случае фамилия несёт отпечаток характера или привычки предка — драчливого или строгого.

Вторая версия связывает прозвище с существительным «кистень» — старинным холодным оружием, гирькой на ремне, которую раскручивали и били врага. Слово это, кстати, заимствовано из тюркских языков. Прозвище Кистик могли дать либо воину, искусно владеющему таким оружием, либо, напротив, человеку неуклюжему и неловкому — с ироничным намёком на то, что он скорее сам себя ударит кистенём, чем противника.

Есть и третья, более прозаичная версия: прозвище могло указывать на небрежность в одежде или поведении. В некоторых говорах «кистень» или «кистик» связывали с болтающимися, свисающими концами одежды, лохмотьями. Тогда Кистиком дразнили неряху или человека, который ходит неопрятно, «распустив кисти».

Фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кисткина, то есть дочь или жена Кистика. Такая форма характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин широко распространены.

В современных справочниках фамилия Кисткина не числится среди массовых, её носители встречаются точечно. Это значит, что род, скорее всего, не был многочисленным, а прозвище Кистик дали одному конкретному человеку, от которого и пошла фамилия.