Фамилия Китом — редкий случай, когда написание подсказывает происхождение. Это не «Китов» и не «Китомов», а форма, застывшая в творительном падеже. В русской ономастике такие фамилии возникали двумя путями: либо от прозвища, которое в речи звучало «за Китом», «с Китом», и падеж приклеился к основе, либо — что вероятнее — это украинская или белорусская фамилия на -ом, где окончание указывает на принадлежность (чьим будешь? — Китом). В украинском языке фамилии вроде Китом, Грибом, Соколом встречаются в западных регионах, особенно на Волыни и в Галиции.

Основа «Кит» могла означать не морское млекопитающее, а прозвище крупного, сильного или важного человека — по аналогии с былинным «Кит-рыбой», на которой держится земля. В северорусских говорах «кит» — это ещё и большая связка чего-либо (кит льна), так что прозвище мог получить торговец или крестьянин, вязавший снопы. В польском языке kit — «замазка», и фамилия могла перейти через границу уже в русифицированной форме.

Модель образования простая: суффикс -ом — это остаток древнего творительного падежа единственного числа (кем? — китом). Такие фамилии фиксировали прозвище в той грамматической форме, в которой его произносили в быту. В переписях XVII–XVIII веков встречаются единичные записи «Ивашко Китом» или «Китомов сын», но массового распространения фамилия не получила — она осталась локальной, очаговой. Географически её следы ведут в юго-западные губернии Российской империи: Киевскую, Подольскую, Волынскую, а также в казачьи области Дона и Кубани, где украинское влияние было сильным.

Спорных версий немного. Иногда Китом ошибочно связывают с английским именем Кит (уменьшительное от Кристофер), но для русской фамилии это экзотика без исторических оснований. Правдоподобнее всего — прозвищная основа, закреплённая падежом. Носителей фамилии сегодня мало, она не входит даже в первую тысячу по частотности, и это как раз тот случай, когда редкое написание сохранило живую грамматику прошлого.