Фамилия Китовнина — редкий случай, когда основа не вызывает споров, а суффикс ставит вопрос. Корень «китовн-» напрямую связан со словом «кит». Но если бы фамилия звучала как Китов или Китовин, вопросов бы не было. Здесь же суффикс -ин- наложился на основу, которая уже содержала -ов- или -ев-, и получилась двойная суффиксация: Китов- + -ин-.

Самый вероятный путь: существовала фамилия Китов (от прозвища Кит — крупный, важный человек или, реже, от названия рыбы). От неё образовали притяжательную форму «Китовна» — так называли жену или дочь Китова. А от «Китовна» по модели «чьих будете?» возникла фамилия Китовнины, то есть «принадлежащие Китовне». В русском языке такая цепочка нормальна: вспомните фамилии типа Кузнецов — Кузнецова — Кузнецовин. Только здесь промежуточное звено — женское отчество, которое стало родовым прозвищем.

Вторая версия, менее вероятная: прозвище Китовня. Так могли назвать человека, связанного с китами — например, промышлявшего добычей китового уса или ворвани. Но это маловероятно для центральной России, где китов не водилось. Однако в Поморье, на Русском Севере, где поморы били китов, такое прозвище могло возникнуть. Тогда Китовнина — «вдова или дочь Китовни».

Географически фамилия привязана к северным и центральным губерниям. Встречается в Архангельской, Вологодской, Вятской областях. В XIX веке носители — в основном крестьяне и мещане. Редкий суффикс -овнин- (как в фамилиях Соковнин, Поповнин) сразу выдает, что фамилия не дворянская, а народная, образованная через женское отчество. Дворяне так свои фамилии не строили.

Итак, если вы Китовнина, то ваш предок, скорее всего, был Китовым или Китовней, а фамилию закрепили по матери или бабушке — что указывает на патриархальный быт, где женщину называли по мужу, а дети шли по её отчеству.