Фамилия Кизрин — редкий случай, когда основа не бросается в глаза. С первого взгляда её хочется связать с тюркским «кыз» (девочка, девушка), но суффикс -ин указывает на принадлежность, а не на прозвище по полу. Гораздо вероятнее, что перед нами вариант фамилии Кизеров, Кизярин или Кизрин, образованной от прозвища Кизря. В русских говорах «кизря» или «кизяк» — это спрессованный навоз, который использовали как топливо в степных и южных регионах. Прозвище могли дать человеку, который заготавливал или продавал кизяк, либо жил в местности, где это было основным топливом.

Суффикс -ин в фамилии типичен для северных и центральных областей России, где на вопрос «чей?» отвечали «Кизрин» — то есть сын или потомок Кизри. В этом случае Кизря — либо прозвище, либо неканоническое имя, которое давали в крестьянской среде по роду занятий. Менее убедительна версия, что основа восходит к диалектному «киз» (в некоторых говорах — «кислый, прокисший»), но она не подкреплена географией фамилии.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основной ареал — юг России, особенно Ростовская область и Краснодарский край, что косвенно подтверждает связь с бытовым топливом (кизяком), характерным для безлесных степных районов. В документах XIX века носители фамилии числятся в основном среди государственных крестьян и казаков — сословий, где прозвища по хозяйственному укладу были нормой.

Таким образом, Кизрин — это фамилия-профессия, застывшая в притяжательной форме. Предок её носителя был либо кизячником, либо получил прозвище от места, где кизяк был частью повседневного быта. Другие этимологии (от имени Кир, от «кизил») не выдерживают проверки словообразованием: суффикс -ин требует основы на -а/-я, а не на согласный.