Фамилия Клопкова ведет свое начало от прозвища Клопок. Вероятно, оно образовано от нарицательного «клоп». Можно предположить, что Клопком называли человека маленького роста. Однако данное прозвище могло указывать и на черты характера предка: Клопком в шутку могли называть навязчивого, неотступного человека. Согласно другой, менее вероятной гипотезе, фамилия Клопкова восходит к прозвищу Клопко, которое может быть связано с украинским глаголом «клопотати». На русский язык он переводится как «тревожить». Вероятно, так называли суетливого, беспокойного, а также заботливого, старательного человека. Так и прозвище Клопок закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Клопкова. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клопок, со временем получил фамилию Клопкова.