Фамилия Клушанцева — женская форма фамилии Клушанцев, а та, в свою очередь, образована от прозвища Клушанец. В основе лежит слово «клуша» — так в старину называли курицу-наседку. Прозвище это было неоднозначным и могло указывать на разные черты. Чаще всего его давали неопрятной, дурно одетой или закутанной женщине — тут срабатывала бытовая аналогия с растрепанной клушей. Однако в тверских и псковских говорах прозвище Клуша закреплялось за женщиной с серыми, быстрыми глазами — по цвету и подвижности, напоминающим куриный взгляд.

Есть и менее очевидная версия: в тверских говорах слово «клуши» означало «черная карточная масть (пики, вины)». Если прозвище Клушанец пошло от этого значения, то оно носило иронический оттенок и могло закрепиться за человеком, который был неравнодушен к азартным играм.

Сама фамилия Клушанцев стоит в ряду редких отпрозвищных фамилий на -анцев. Суффикс -ец в прозвище Клушанец указывал на принадлежность к определённому признаку или месту, а последующее добавление -ев оформило фамилию по стандартной русской модели. В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён, Клушанцева напрямую отсылает к бытовому или диалектному прозвищу предка. Поскольку слово «клуша» — женского рода, прозвище чаще давали женщинам, но фамилию мог унаследовать и мужчина — потомок той самой Клуши.