Фамилия Кнюпа — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа не славянская, а немецкая, что сразу выделяет носителя из ряда типичных русских фамилий. В основе лежит немецкое слово Knippe или Knüppe — «дубинка», «палка», «короткий кнут». Скорее всего, прозвище Кнюпа получил человек крепкого сложения, либо тот, кто ходил с дубинкой (пастух, сторож, лесник). В немецких говорах слово могло означать и «упрямого человека» — того, кто «гнёт свою линию», как дубинку не согнёшь.

Фамилия образована без типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский). Это так называемая «чистая» основа — прозвище перешло в фамилию без изменений, что характерно для украинской и южнорусской традиции, а также для фамилий, заимствованных из других языков. Встречается она прежде всего на западе и юге России, в регионах, куда в XVIII–XIX веках приглашали немецких колонистов: Поволжье, Новороссия, Санкт-Петербургская губерния. Если предки носителя были из немецких поселенцев, то Кнюпа могла быть искажением фамилии Knüpfer (медник, лудильщик) или Knopf (пуговица, пуговичник) — звуки «п» и «ф» часто путали при записи.

В русском языке фамилия склоняется по образцу существительных женского рода: Кнюпа, Кнюпы, Кнюпе. Это тоже редкость — большинство русских фамилий на -а склоняются как слова мужского рода (Воевода, Савва), а здесь форма женского рода закрепилась за всеми носителями, независимо от пола. Такое бывает, если фамилия пришла из языка, где род исходного слова женский, или если её записали по аналогии с украинскими фамилиями на -а (Шульга, Паливода).

Сведений о знатных или широко известных носителях фамилии Кнюпа в открытых источниках нет. Это фамилия людей труда — ремесленников, крестьян, мелких служащих. Если ваш предок носил её, скорее всего, он был человеком с Запада России или потомком немецких колонистов, а его прозвище указывало на характер, профессию или внешность — крепкий, прямой, как дубинка.