Фамилия Кодушкин — редкая и неочевидная с первого взгляда. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться не с корнем, а с суффиксом. Модель образования здесь классическая русская: основа + суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Кодушкин» значило «сын Кодушки» или «человек из семьи Кодушки». А вот что такое «Кодушка» — главный вопрос.

Самая вероятная версия: Кодушка — это уменьшительно-ласкательная форма неканонического имени или прозвища Код, Кода. В русских говорах слово «кода» имело несколько значений. В новгородских и псковских диалектах «кода» — это «беда», «напасть», «неприятность». Прозвище Кода могли дать человеку неудачливому или, наоборот, в качестве оберега от злых сил — чтобы беда обходила стороной. От этого прозвища через форму Кодушка (с уменьшительным суффиксом -ушк-) и появилась фамилия Кодушкин.

Менее правдоподобная, но возможная версия связывает фамилию с церковным именем Кодрат (в русском обиходе — Кодрат, Кодратий). В народном произношении имя могло сократиться до Кода, а затем обрасти уменьшительными формами. Однако в пользу прозвищной версии говорит то, что фамилия Кодушкин — редкая и локальная. Встречается она преимущественно в старых документах по Новгородской, Псковской и Тверской губерниям — именно в тех краях, где диалектное слово «кода» было в ходу. Если ваши предки родом оттуда, скорее всего, фамилия пошла от прозвища, а не от крестильного имени.

Любопытно, что фамилия Кодушкин не имеет очевидных однокоренных «родственников» вроде Кодов или Кодин. Это говорит о том, что прозвище Кода было не слишком распространённым, а его уменьшительная форма Кодушка закрепилась в фамилии буквально в одной-двух семьях. Так что носители фамилии Кодушкин, скорее всего, происходят из одного небольшого рода, где прозвище предка передалось по наследству и сохранилось в почти неизменном виде.