Фамилия Коджамонян — армянского происхождения. Её структура типична для армянской ономастики: основа плюс патронимический суффикс -ян (или -янц), означающий «принадлежащий к роду» или «потомок». В русской традиции окончание часто упрощается до -ян, что мы и видим.

Корень фамилии — «Коджамон» — составной. Первая часть, «Коджа» (или «Кочо», «Коджо»), восходит к турецкому или армянскому слову со значением «господин», «старший», «хозяин», «большой». Вторая часть, «мон», может быть вариантом армянского «ман» («человек») или искажением другой основы. Таким образом, «Коджамон» — это, вероятно, прозвище, означающее «большой человек» или «господин». В тюркских языках «коджа» (koca) также имеет значение «муж», «супруг», что добавляет ещё один смысловой оттенок: «мужчина» или «глава семьи».

Вероятнее всего, фамилия Коджамонян сформировалась в среде армян, живших в Османской империи или в регионах с сильным тюркским влиянием (Западная Армения, Киликия). Носители такого прозвища могли быть уважаемыми ремесленниками, торговцами или сельскими старостами — людьми, которых в общине называли «коджа» за авторитет или физическую стать.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, Коджамонян — это фамилия-прозвище по социальному положению или личным качествам. Она не имеет никакого отношения к географии или профессии, а прямо указывает на статус предка. Встречаемость фамилии невысока, что характерно для узкорегиональных армянских родов, не получивших массового распространения после переселений.