Фамилия Колданова — женская форма от мужской Колданов, и её разбор стоит начать с суффикса. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования от отчества или прозвища: Колдан → сын Колдана → Колданов. Значит, в основе лежит прозвище или неканоническое имя Колдан.

Слово «колдан» в русских говорах имеет несколько значений. В северных и сибирских диалектах колданом называли колдуна, знахаря или человека, занимающегося ворожбой. Это самое вероятное объяснение: прозвище могли дать тому, кого подозревали в колдовстве, кто лечил заговорами или просто вёл себя необычно. Подтверждение этому — фамилия Колдунов, которая существует параллельно и образована от того же корня, но с более прямым значением. Форма Колданов могла возникнуть как диалектный вариант: в некоторых говорах «колдун» звучало как «колдан».

Менее распространённая версия связывает основу с тюркскими языками, где «колдан» означало «раб» или «невольник». Однако для русской фамилии, зафиксированной преимущественно в центральных и северных областях России, такое заимствование маловероятно. Тюркская версия могла бы объяснять фамилию у народов Поволжья, но для Колдановых с русскими корнями она слаба.

Географически фамилия встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — как раз в зоне бытования северных говоров, где слово «колдан» было в ходу. Это косвенно подтверждает диалектную версию происхождения.

Сословная принадлежность предков Колдановых не прослеживается по самой фамилии: такие прозвищные фамилии могли носить и крестьяне, и мещане, и даже священники (если прозвище давали за необычную внешность или поведение). Точных данных о конкретном носителе, с которого пошла фамилия, нет — это типичная ситуация для прозвищных фамилий, не связанных с дворянскими родами.