Фамилия Комариста — редкий случай, когда основа слова не оставляет сомнений в занятии предка. Корень «комар» и суффикс «-ист» указывают на человека, чья работа была связана с комарами. Но не с ловлей или разведением, а с их устранением. В южных и центральных губерниях Российской империи так могли называть того, кто профессионально боролся с комарами и мошкой — ставил дымокуры, мазал скот отпугивающими составами, расчищал болотистые места. Это было ремесло, особенно востребованное в поймах рек, где мошкара делала жизнь невозможной.

Суффикс «-иста» — нехарактерный для русской фамильной модели. Обычно русские фамилии образуются суффиксами «-ов/-ев», «-ин», «-ский». А вот «-ист» — заимствование из греческого через латынь; в русском языке он давал названия профессий (машинист, связист) и прижился в фамилиях украинских и южнорусских территорий, где было сильное влияние польской и малороссийской ономастики. Комариста — типичный пример такой «профессиональной» фамилии, закрепившейся за целым родом.

Встречается фамилия почти исключительно на Украине и в южных областях России. В старых метрических книгах её носители — крестьяне и мещане, люди, жившие у воды или в лесистой местности. Прозвище «Комарист» было не насмешливым, а функциональным: оно обозначало конкретную работу, которую человек делал для общины. Со временем прозвище перешло в фамилию без изменений, сохранив исходную форму.

Сравните с однокоренными фамилиями: Комаров (самая частая, от прозвища «Комар» — назойливый человек), Комаренко (украинский патроним «сын Комара»), Комаровский (дворянская или семинарская переделка). Комариста стоит особняком — это не прозвище по характеру, а редкий случай, когда фамилия прямо называла профессию, а не внешность или поведение.