Фамилия Комендра — редкая и неочевидная. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, поэтому её происхождение нужно искать не в типичной модели «сын такого-то», а в прямом прозвище или в географическом названии.

Скорее всего, основа фамилии — прозвище Комендра. В южнорусских и украинских говорах словом «комендра» называли человека суетливого, непоседливого или того, кто постоянно командует, распоряжается без толку. Связь с глаголом «командовать» здесь прямая, но с пренебрежительным оттенком: не начальник, а именно суетливый распорядитель. Такие прозвища давали в крестьянской среде — не в злобу, а чтобы подметить характерную черту.

Вторая версия — польское или белорусское происхождение. В польском языке есть слово «komendra» в значении «комендант» или «управляющий», но в переносном смысле — опять же, человек, любящий покомандовать. Фамилия могла попасть в русский язык через территории бывшей Речи Посполитой: современные западные области Украины, Беларуси или Польши. Суффикс -а на конце типичен для западнославянских фамилий (сравните: Ковальчук, Мазура, Комендра).

Третья, менее вероятная гипотеза — связь с немецким «Kommandeur» (командир), но в этом случае фамилия должна была бы звучать иначе и скорее всего писалась бы через «д» с мягким знаком. Поэтому версия с местным прозвищем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Комендра встречается в основном в западной части России, на Украине и в Беларуси. В дореволюционных переписях она не была распространена, что говорит о её локальном, возможно, даже деревенском происхождении. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а прозвище закрепилось за родоначальником из-за его живого, деятельного нрава.

Если у вас есть семейные предания, что предки были военными или управляющими, версия с польским «комендрой» получает дополнительный вес. Но без документов точнее сказать трудно: фамилия Комендра — из тех, что хранят тайну в самом слове, а не в суффиксе.