Фамилия Комерческий — редкий случай, когда в основе лежит не русское слово, а заимствованное из французского языка «коммерция» (в прошлом оно писалось с одной буквой «м»). В словаре Даля значение этого слова определяется как «торг, торговля, торговые обороты, купецкие промыслы». Именно от этой основы и образована фамилия, причем модель образования здесь необычная: суффикс -ск- указывает на принадлежность или отношение к чему-либо. В русской ономастике фамилии на -ский/-цкий чаще всего либо дворянские (по названию владения), либо семинарские (искусственно созданные в духовных училищах). Но Комерческий к этим группам явно не относится.

Скорее всего, перед нами прозвищная фамилия, которая закрепилась за человеком, имевшим прямое отношение к коммерции — торговле. В прошлом одним из основных торговых путей считались реки и моря. Именно благодаря водным путям стали развиваться торговые связи Руси с другими странами. Русские купцы вывозили в Западную Европу меха и кожи, «рыбьи зубы» (так в старину назывались моржовые клыки), а также лен, сало и мед. На русские рынки купцы приводили из Европы и Азии серебро и медь, стекло, различные изделия из золота, ткани и оружие. Поэтому можно предположить, что основатель рода Комерческих был купцом.

Однако есть и другая версия: фамилия могла быть искусственной, «кабинетной». В XVIII–XIX веках в России появлялись «говорящие» фамилии, которые давали, например, приписным крестьянам или мещанам по роду их занятий. В этом случае Комерческий — аналог фамилий Торговцев, Купецкий или Барышников, но с более книжным, европейским звучанием. Такие фамилии нередко встречались в южных и западных губерниях, где было сильнее влияние польской и украинской традиции образования фамилий на -ский.

Географически фамилия редкая и не имеет массового распространения. Встречается в основном в центральной России и Поволжье, единичные случаи — в Сибири. Вариант написания с одной «м» (Комерческий вместо Коммерческий) — исторический: до реформы орфографии 1918 года слово «коммерция» и производные от него часто писали с одной буквой «м», следуя французскому оригиналу commerce. Так что современное написание фамилии — не ошибка, а архаичное свидетельство её давнего происхождения.