Фамилия Комердус — редкий пример, когда фамилия, звучащая по-русски, скорее всего, имеет не славянское, а латинское происхождение. С высокой вероятностью, её основа восходит к латинскому слову «comoedus» — комический актёр, лицедей. В Древнем Риме так называли исполнителей в комедийных представлениях, и это слово перешло в европейские языки, например, в немецкий Komödiant. Фамилия Комердус могла возникнуть в среде немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или в прибалтийских землях, где латинская традиция была сильнее. В таком случае, предок носителя фамилии мог быть странствующим актёром, комедиантом или просто человеком с весёлым нравом, которому дали прозвище «комедиант».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с церковной латынью. Слово «commercium» означает «торговля», а «commerdus» могло бы быть искажённой формой, обозначающей торговца. Однако эта гипотеза слабее, так как фонетически «Комердус» ближе к «комедианту», чем к «коммерции». Кроме того, окончание «-ус» типично для латинизированных фамилий, которые давались в семинариях или университетах, но в данном случае оно, скорее, указывает на немецкую или польскую адаптацию латинского корня.

Словообразовательный разбор показывает, что в фамилии нет славянских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Это говорит о том, что фамилия не образовывалась на русской почве от отчества или прозвища, а пришла уже в готовом виде. Географически фамилия Комердус встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает её возможное польское или немецкое происхождение. В польском языке есть фамилия Komerdus, которая могла возникнуть как вариант от Komeda (прозвище актёра) с латинизированным окончанием.

Версия о происхождении от названия населённого пункта (например, немецкого Kommerd) маловероятна, так как таких топонимов не зафиксировано. Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение: фамилия Комердус — это латинизированное прозвище, данное предку-актёру, комедианту или просто остроумному человеку, и закрепившееся в западных регионах бывшей Речи Посполитой или среди немецких колонистов.