Фамилия Кометов — один из ярких примеров «семинарских» фамилий, то есть искусственных именований, которые давали ученикам духовных училищ и семинарий. Такие фамилии не образовывались от прозвищ или профессий предков, а придумывались наставниками. Поводов было несколько: если у поступающего не было фамилии, если хотели поощрить способного ученика красивым именем или, наоборот, наказать нерадивого. Фамилия Кометов, скорее всего, относится к «поощрительному» варианту — её могли дать семинаристу, увлекавшемуся астрономией, или просто как звучное, книжное имя от слова «комета». Само слово «комета» заимствованное, от греческого kometes — «косматый, длинноволосый» (древние греки так назвали небесное тело за его «волосатый» хвост).

Интересная деталь: слово «комета» женского рода, а фамилия образована с мужским суффиксом -ов. Это характерная черта семинарских фамилий — их часто строили не по бытовым правилам, а по книжной логике. Например, от слова «роза» делали фамилию Розов, а не Розин, хотя суффикс -ов по правилам присоединяется к основам мужского рода. Так и Кометов — форма, закреплённая в документах, а не в живой речи.

Есть и другие версии происхождения, хотя они менее вероятны для русской фамилии. Первая: от древнеславянского слова «комет» или «кмет» — так на Руси называли витязей, дружинников. В этом случае прозвище Комет мог получить воин, а от него уже пошла фамилия. Вторая гипотеза выводит фамилию из тюркских корней: от имени Комет (Камет) — диалектного варианта персидско-таджикско-арабского имени Калмухаммет, что значит «счастливый Мухаммет» (буквально — «имеющий родинку»). Однако для русской семинарской среды такое объяснение выглядит натянутым: гораздо естественнее, что семинаристу просто дали фамилию по небесному телу.

Фамилия Кометов редкая. Её носители живут в основном в Центральном и Приволжском федеральных округах России.