Фамилия Комисьянов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а церковная должность, прошедшая через несколько языковых фильтров. Прямой и самый очевидный источник — слово «комисьян», искажённая форма от «комиссионер». В дореволюционной России так называли поверенных, посредников при торговых сделках или сборщиков податей. Однако, если копнуть глубже, фамилия может восходить к греческому «комис» — «попечитель», «блюститель» или даже к латинскому «commissio» — «поручение». В любом случае, предок носителя этой фамилии был человеком, которому доверяли: либо он выполнял ответственные поручения, либо служил при церкви, заведуя хозяйством или сбором пожертвований.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Комисьянов буквально означает «сын Комисьяна». Само имя Комисьян — это народная, «обмирщённая» форма канонического церковного имени. В церковных метриках XVII–XVIII веков можно встретить варианты Комиссан, Комиссий, а в быту их сокращали до Комисьян. Интересно, что фамилия почти не встречается в центральных губерниях России — её ареал тяготеет к югу, к Курской, Воронежской, Харьковской губерниям, где было сильно влияние украинского произношения с его «и» на месте «е» и смягчением согласных.

В написании фамилии часто путают: встречаются варианты Комесьянов, Камисьянов и даже Кумисьянов. Но исходная форма с «о» в первом слоге и «и» во втором — Комисьянов — наиболее устойчива. В словарях фамилия не зафиксирована, что говорит о её редкости: по подсчётам современных ономастов, в России едва ли наберётся несколько сотен её носителей. Социальный статус предков был, скорее всего, мещанским или купеческим — люди, связанные с делопроизводством, торговлей или церковным хозяйством, редко бывали крепостными крестьянами.