Фамилия Комнацкая — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с профессией или внешностью, а с местом жительства в узком, почти бытовом смысле. Разберём её по составу. Корень «комнат-» прямо указывает на слово «комната» (от лат. caminata — отапливаемое помещение). Суффикс «-ц-» в данном контексте выступает как часть прилагательного, а окончание «-ая» — типичный признак женского рода в фамилиях на -ский/-цкий. Получается, что исходное слово — «комнатский» или «комнацкий», то есть «относящийся к комнате».

Самая правдоподобная версия: фамилию дали человеку, который жил не в собственном доме, а в «комнате» — снимал угол, жил при барском доме в отдельной комнате или работал «комнатным» слугой (например, горничной или камердинером). В крестьянской среде до отмены крепостного права иметь отдельную комнату было роскошью, поэтому прозвище «Комнатный» или «Комнацкий» могло закрепиться за дворовым человеком, жившим в господском флигеле, либо за мещанином, который сдавал жильё. Форма Комнацкая — женская, то есть либо жена, либо дочь Комнацкого.

Менее вероятно, но не исключено, что фамилия связана с прозвищем «Комната» — так могли назвать человека домоседливого, замкнутого, который «всё в комнате сидит». Однако в русской ономастике прозвища от названий частей дома встречаются реже, чем от профессий или имён, и обычно они конкретнее: например, Подклетов (от подклеть — нижний этаж) или Сенников (от сеновала). «Комнацкий» звучит как указание на социальный статус, а не на черту характера.

Географически фамилия редкая. Встречается в западных и южных регионах бывшей Российской империи (Украина, Беларусь, юг России), где польское или малороссийское влияние могло дать суффикс «-цкий» вместо великорусского «-ный». В польском языке слово «komnata» означает «палата, комната», и фамилия Komnacki (Комнацкий) там тоже существует, но с тем же смыслом: «тот, кто живёт в комнате» или «владелец комнаты».

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Комнатный, Комнатнов — то Комнацкая стоит особняком: суффикс «-цк-» придаёт ей оттенок шляхетского звучания, хотя происхождение, скорее всего, не дворянское, а простонародное. Владелец такой фамилии мог быть выходцем из прислуги или мелких арендаторов, которые не имели собственной избы, а снимали «комнату» — что в XIX веке было признаком бедности, а не достатка.