Фамилия Комолкина образована от прозвища Комолка. В словаре В. Даля слово «комолка» трактуется как «шишка, в разных значениях — твердый нарост, особенно вместо рога». Эта основа и определяет главные версии происхождения фамилии, и у каждой — своя логика.

Первая версия — прозвище по внешности. Комолкой могли назвать человека с какой-то заметной шишкой или наростом на теле. Вторая версия уходит в крестьянский быт: комолыми называли безрогих коров или быков. Прозвище Комолка мог получить человек, у которого в хозяйстве была такая скотина, или тот, кто занимался спиливанием рогов у бодливых животных — ради безопасности. Третья версия отсылает к слову «комель» — нижний, утолщенный конец растения, бревна или пера. Если так, то прозвище могли дать лесорубу, работавшему с толстыми концами бревен.

Словообразовательная модель здесь простая: основа Комолк- плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Комолки). Это типичная для русских фамилий патронимическая конструкция, только в роли личного имени выступает прозвище. Встречается она в основном в центральных и северных регионах России.

Какая из версий правдоподобнее? Скорее всего, прозвище всё же связано с отсутствием рогов — либо у самого человека (как метафора), либо у его скота. Это самое прямое и частое употребление слова «комолый» в народной речи. Версия с «комлем» слабее, потому что такое прозвище скорее дали бы по форме Комель, а не Комолка. В любом случае, прозвище Комолка закрепилось за человеком как основное бытовое имя, а затем перешло в фамилию, сохранив память о занятии или внешней особенности предка.