Фамилия Комратовы — редкий случай, когда основу можно проследить до конкретного города на карте. Речь о Комрате, городе на юге Молдавии, стоящем на реке Ялпуг. Первые упоминания о Комрате в документах относятся к 1789 году, а после 1812 года, когда Бессарабия вошла в состав Российской империи, населённый пункт оказался в её границах. Сама фамилия образована по типичной восточнославянской модели: к названию места прибавили суффикс -ов, и «Комратов» буквально означает «выходец из Комрата» или «принадлежащий к Комрату». Это так называемый топонимический тип фамилий — их давали переселенцам, чтобы отличить человека, пришедшего с чужбины, от местных жителей.

Вероятнее всего, предок носителей этой фамилии покинул Комрат и осел в другом регионе, где его прозвище «Комрат» закрепилось за детьми и внуками как родовое имя. Сложно сказать, когда именно это произошло: фамилии у крестьян и мещан в России и Молдавии оформлялись на протяжении всего XIX века, нередко после отмены крепостного права. Но есть одна историческая деталь, которая делает топоним особенно примечательным. В 1906 году крестьяне села Комрат Бендерского уезда подняли восстание против помещиков, арестовали местных чиновников и провозгласили так называемую Комратскую республику. Просуществовала она всего пять дней и была подавлена царскими войсками. Этот эпизод показывает, что Комрат был не просто захолустьем, а местом с активной социальной историей.

Сама фамилия — памятник не столько славянской письменности вообще, сколько конкретному историко-географическому контексту: она связывает русского или украинского носителя с молдавскими землями, которые в разное время входили в состав разных государств. О точном месте и времени возникновения фамилии Комратов сейчас говорить сложно, но её топонимическая основа не вызывает сомнений.