Фамилия Комратов происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Комратов восходит к топониму Комрат — город в Молдавии, расположенный на реке Ялпуг. Первые официальные упоминания о городе датируются 1789 годом. В 1812 году Бессарабия (вместе с Комратом) вошла в состав России. В 1906 году крестьяне села Комрат Бендерского уезда начали борьбу за раздел помещичьих земель, арестовали чиновников местной власти и провозгласили Комратскую республику, которая просуществовала всего 5 дней. Это восстание было подавлено царскими войсками. Статус города Комрат получил в 1957 году. Вероятно, основатель фамилии Комратовых был выходцем из этого населенного пункта. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Комрат, со временем получил фамилию Комратов. О точном месте и времени возникновения фамилии Комратов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Комратов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.