Фамилия Комратова напрямую связана с географическим названием — городом Комрат в Молдавии, на реке Ялпуг. Это типичная «топонимическая» фамилия, которую давали переселенцам по месту их прежнего жительства. Предок, носивший прозвище Комрат, скорее всего, был выходцем из этого бессарабского города и получил фамилию по принципу «откуда человек родом».

История самого Комрата примечательна. Первые официальные упоминания о нём относятся к 1789 году, а в 1812 году Бессарабия вместе с Комратом вошла в состав Российской империи. В 1906 году крестьяне села Комрат Бендерского уезда подняли восстание за раздел помещичьих земель, арестовали местных чиновников и на пять дней провозгласили Комратскую республику. Восстание подавили царские войска, а статус города Комрат получил только в 1957 году. Таким образом, фамилия Комратова — это не просто указание на место рождения, а возможная связь с бурной историей края.

Словообразовательная модель проста: к основе Комрат добавился суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Комратов сын). Женская форма Комратова — это естественное грамматическое окончание для носительницы фамилии. В отличие от многих фамилий, образованных от прозвищ, здесь нет споров о значении корня: он прозрачен и привязан к конкретному городу на юге Молдавии.

Фамилия довольно редкая и встречается в основном в южных регионах России и на постсоветском пространстве, что подтверждает её географическое происхождение. Встречаются и однокоренные варианты вроде Комратовский, но именно форма Комратова сохраняет прямую отсылку к исходному топониму без дополнительных суффиксов.