Фамилия Комнатова — женская форма фамилии Комнатов, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В русском языке слово «комната» известно с XVI–XVII веков и пришло из польского или немецкого (через посредство латинского caminata — «отапливаемая комната»). Однако фамилия Комнатов вряд ли напрямую связана с этим бытовым понятием: прозвище «Комната» или «Комнатный» маловероятно для крестьянской среды, где жили в избах, а не в комнатах.

Более правдоподобна версия, что в основе лежит не существительное «комната», а личное имя или прозвище Комнат. В старых русских говорах встречалось слово «комнат» в значении «крупный, толстый» (от диалектного «ком» — ком, глыба). Такое прозвище могли дать плотному, коренастому человеку. Суффикс -ов/-ев стандартно указывает на принадлежность: Комнатов — сын Комната.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Комов, Комков) подтверждает эту версию: все они образованы от прозвищ, связанных с округлой формой или физической крепостью. Встречаются Комнатовы преимущественно в центральных и северных регионах России, где диалектное слово «комнат» бытовало чаще.

Таким образом, предки современных Комнатовых получили прозвище за внешность или стать, а не за интерьер. Фамилия редкая, но её корень — в живом народном языке, а не в заимствованной лексике.