Фамилия Комутова — женская форма, а её мужской вариант Комутов. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Комут. Слово «комут» в старых русских говорах означало «хомут» — часть конской упряжи. Скорее всего, прозвище получил либо человек, делавший хомуты (шорник или ремесленник), либо тот, кто, по мнению окружающих, был похож на хомут — возможно, полный, грузный человек, поскольку хомут плотно охватывает шею лошади. В переносном смысле «комутом» могли назвать и того, кто «надевает хомут» на других, то есть заставляет работать или подчиняет.

Слово «комут» — древнее заимствование из тюркских языков (ср. татарское «комыт»). В русских диалектах, особенно в южных и центральных губерниях, оно было широко распространено, поэтому фамилия Комутов встречается нередко. Суффикс -ов указывает на типичную патронимическую модель: Комутов — сын Комута. То есть фамилия образовалась от личного прозвища отца, которое со временем закрепилось за его потомками.

В отличие от фамилий на -ин, образованных от основ на -а/-я, здесь использован суффикс -ов, что характерно для прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный. Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Хомутов, то Комутов — более редкий вариант, сохранивший диалектное произношение. Встречается фамилия в основном в Поволжье и на юге России, где тюркские заимствования в бытовой лексике были особенно сильны.

Точных сведений о сословной принадлежности первых Комутовых нет. Скорее всего, это были крестьяне или ремесленники, так как прозвище связано с конкретным занятием или бытовой деталью. Никаких дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано.