Фамилия Конапушкина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет распространённых суффиксов вроде -ов или -ин, что сразу наводит на мысль: перед нами не стандартная «патронимическая» фамилия (от имени отца), а скорее прозвищная, причём образованная по модели, характерной для северных и центральных областей России.

Ключ к разгадке — основа «Конапушк-». Скорее всего, это не один корень, а два, соединённые в народном прозвище. Первая часть — «Кон-» может восходить к слову «конь» (лошадь) или к краткой форме имени Конон (в народе — Кон, Кона). Вторая часть — «-пушк-» — почти наверняка связана со словом «пушка» или, что вероятнее, с глаголом «пушить» (взбивать, делать пушистым). Таким образом, прозвище «Конапушка» мог получить человек, который, например, «пушил коня» — чистил лошадь скребницей, делал её гриву пушистой. Это ремесленная, бытовая характеристика: конюх или коновал.

Вторая версия, менее бытовая, но тоже возможная: прозвище от «конопушка» — так в некоторых говорах называли веснушки (от слова «конопля», «конопатый»). Человека с веснушчатым лицом могли дразнить Конопушкой, а со временем «н» могло выпасть или перейти в «Конапушка». Это чисто фонетическое изменение, типичное для живой речи: «конопушка» → «конапушка».

Суффикс -ин в окончании фамилии (Конапушк-ин-а) указывает на принадлежность: «чей?» — «Конапушкина», то есть дочь или жена Конапушки. В женской форме фамилия закрепилась, как это часто бывает, от прозвища главы семьи.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям — Архангельской, Вологодской, Ярославской, Костромской. Именно там были распространены прозвища, образованные от ремёсел (конюх, коновал) и от внешних черт (конопатый, веснушчатый). В южных регионах такая форма встречается реже.

Социально предки носительницы фамилии Конапушкина, скорее всего, относились к крестьянскому или посадскому сословию. Прозвище не указывает на дворянское происхождение — это «низовая», народная ономастика, где за каждым словом стоит конкретная профессия или особенность внешности. Дворянские фамилии в России обычно оканчивались на -ский/-цкий или образовывались от полных церковных имён.

Итог: фамилия Конапушкина происходит от прозвища Конапушка, которое, с наибольшей вероятностью, означало «конюх» (человек, ухаживающий за лошадьми) или, реже, «веснушчатый человек». Это редкая, но хорошо читаемая фамилия, сохранившая в себе бытовую деталь жизни русского крестьянина или посадского человека.