Фамилия Конфедератенко — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание необычной основой. В отличие от большинства украинских фамилий на -енко, образованных от крестильных имён (Иващенко, Гриценко) или названий профессий (Коваленко, Ткаченко), эта стоит особняком. Её корень — «конфедерат», то есть участник конфедерации, член военно-политического союза. В украинской истории это слово имеет конкретное значение: конфедератами называли участников польских шляхетских союзов, а позднее — сторонников гетмана Петра Дорошенко, который в XVII веке заключал союз с Османской империей против Речи Посполитой.

Модель образования проста: к основе «конфедерат» добавили патронимический суффикс -енко, который по-украински означает «сын» или «потомок». Таким образом, Конфедератенко — буквально «сын конфедерата». Фамилия указывает не на ремесло или внешность, а на политическую или военную принадлежность предка. Вероятнее всего, первый носитель фамилии либо сам состоял в каком-либо конфедератском объединении, либо получил прозвище от окружающих за связь с этим движением.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкасщине. В России она встречается редко и чаще всего — у потомков переселенцев с Украины. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения: в отличие от массовых Коваленко или Шевченко, Конфедератенко осталась локальной и малочисленной. Это говорит о том, что прозвище «конфедерат» не стало типовым — его давали не каждому, а лишь тем, кто реально участвовал в конфедератских событиях или был известен своей приверженностью этой политической линии.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Конфедератов, Конфедерацкий) показывает, что украинская форма на -енко — самая конкретная: она прямо называет родство, а не просто принадлежность к группе. Если Конфедератов мог получить бывший конфедерат или его крепостной, то Конфедератенко — это именно потомок, «сын конфедерата». Такая точность типична для украинской антропонимии XVII–XVIII веков, когда фамилии только закреплялись, и патроним часто становился родовым именем.